Restriktaj enzimoj

El Vikipedio, la libera enciklopedio
Saltu al: navigado, serĉo

Malkovrataj ekde 1973, restriktaj enzimoj kapablas rekoni specife mallongan sinsekvon de 4 ĝis 10 bazparoj kaj distranĉi DNA-n ĉe la rikonita loko. Ili ebligas erigi DNA en reduktitajn fragmentojn aŭ trafe distranĉi DNA ĉe specifa loko.La distranĉebla loko ĉe DNA estas palindronaj sinsekvoj, tio signifas ke inversigante nukleotidoj-sinsekvon, oni havigas la saman nukleotid-ordon. Ekz: ATGTA inverse estas ATGTA ankau.Ju pli longas la sinsekvo, des pli ĝi estas mallofta. Estas facile kompreni ke ATA estas pli ofte renkontebla kombinaĵo ol ATGCGTA.

Netfina tranĉo[redakti | redakti fonton]

Netfina tranĉo: Restrikta enzimo distranĉas nete la dufadenan DNA-n.

Iuj enzimoj distranĉas DNA-lokon meze de ĝi kaj produktas du fragmentojn kies ekstremaĵoj estas netaj. Temas tiam pri netfina tranĉo.

Kunteniĝa tranĉo[redakti | redakti fonton]

Kunteniĝa tranĉo: Restrikta enzimo distranĉas malnete la dufadenan DNA-n.

Plej parto de la enzimoj tamen distranĉas malsimetrie: oni parolas tiukaze pri kunteniĝa tranĉo (aŭ malnetfina tranĉo). Ĉiu fragmento havas fadenon pli longan ol la alian. Pluraj centoj el tiuj enzimoj estis karakterizitaj: ili rekonas grandan variecon de tiaj distranĉoj.

Uzado[redakti | redakti fonton]

Restriktaj enzimoj estas uzataj por:
establi tranĉaran mapon de ĉiuj DNA-molekuloj kiujn oni
deziras karakterizi. Tio konsistas el determino de la resktriktejoj-ordo laŭlonge de la konsiderata molekulo, kiuj produktos, post ties « enzima digestado », divers-longajn fragmentojn kies longeco povos esti difinita per elektroforezo.
manipuli DNA ĝenerale. Oni ekzemple povas tranĉi plasmidon antaŭ fremd-DNA-enplasmidigo...







Ekzemploj[redakti | redakti fonton]

Enzimo           Organismo-fonto                   Rekonita sinsekvo       Tranĉejo
EcoRI        Escherichia coli                      5'GAATTC              5'---G     AATTC---3'
                                                   3'CTTAAG              3'---CTTAA     G---5'
BamHI        Bacillus amyloliquefaciens        5'GGATCC              5'---G     GATCC---3'
                                               3'CCTAGG              3'---CCTAG     G---5'
HindIII      Haemophilus influenzae            5'AAGCTT              5'---A     AGCTT---3'
                                               3'TTCGAA              3'---TTCGA     A---5'
MstII        Microcoleus species               5'CCTNAGG
                                               3'GGANTCC        
TaqI         Thermus aquaticus                 5'TCGA                5'---T   CGA---3'
                                               3'AGCT                3'---AGC   T---5'
NotI         Nocardia otitidis                 5'GCGGCCGC
                                               3'CGCCGGCG       
HinfI        Haemophilus influenzae            5'GANTC
                                               3'CTNAG
AluI         Arthrobacter luteus               5'AGCT                5'---AG  CT---3'      
                                               3'TCGA                3'---TC  GA---5'

Eksteraj ligiloj[redakti | redakti fonton]

Restriction enzyme.jpg
Sma1.jpg