Filogeneza arbo: Malsamoj inter versioj
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'''Filogenetika arbo''' estas arboforma skemo, kiu bildigas kiel el unu [[specio]] [[evoluo|evoluis]] pluraj. |
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<!-- Damit ist ein phylogenetischer Baum eine Form des |
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[[Kladogramm]]s. |
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In einem phylogenetischen Baum repräsentiert jeder [[Knoten (Graphentheorie)|Knoten]] mit Vorfahren den ''nächsten gemeinsamen |
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Verwandten'' dieser Vorfahren. Die Kantenlänge entspricht meist der |
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geschätzten Zeit, in der sich die Arten separiert haben, oder der |
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Anzahl der [[Mutation]]en, die während dieser Entwicklung passierten. |
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Jeder Knoten in einem phylogenetischen Baum wird als ''taxonomische |
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Einheit'' bezeichnet, wobei man innere Knoten oft als ''hypothetische |
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taxonomische Einheiten'' bezeichnet, wenn die entsprechenden Arten |
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oder Einheiten nicht beobachtet werden können. |
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==Datenquellen und Interpretation== |
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Phylogenetische Bäume werden heute meist anhand von [[Sequenzanalyse|sequenzierten]] |
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[[Gen]]en der untersuchten Spezies aufgebaut. Dabei berechnet man ein |
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[[Sequenzalignment]] des gleichen Gens (oder evtl. der gleichen Gene) |
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dieser Arten, und verwendet die im Alignment erscheinenden |
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Ähnlichkeiten und Unterschiede, um den Baum aufzubauen. Arten, deren |
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Sequenzen ähnlich sind, liegen im Baum dann wahrscheinlich näher |
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beieinander als solche mit stark unterschiedlichen Sequenzen. Da die [[Zeitkomplexität|Komplexität]] der Berechnung solcher Bäume jedoch mit der Anzahl der Sequenzen exponentiell ansteigt, verwendet man [[Heuristik]]en, um die Bäume zu generieren. |
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Ziel der Erstellung phylogenetischer Bäume ist es, die Evolution möglichst detailliert zu erklären. Allerdings weiß man heute, dass die Gene sich nicht gleichmäßig |
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entwickelt haben. Einige Gene, die heute im [[Körper des Menschen]] |
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vorkommen, haben beispielsweise nur gemeinsame Vorfahren mit dem |
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[[Schimpanse]]n, andere kommen in allen [[Säugetier]]en vor, etc. |
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Deshalb können bei der phylogenetischen Analyse verschiedener Gene der |
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gleichen Spezies unterschiedliche phylogenetische Bäume entstehen, die |
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für sich jedoch alle korrekt sind. Um die Entstehungspunkte und |
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Verzweigungen bei der Evolution der |
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einzelnen Arten festzustellen, müssen deshalb verschiedene Genregionen |
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untersucht werden. Weiterhin sollten Ergebnisse aus der klassischen |
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[[Phylogenie]] sowie morphologische Merkmale zur Interpretation |
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hinzugezogen werden. |
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==Gewurzelte und ungewurzelte Bäume== |
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Ein ''gewurzelter'' phylogenetischer Baum ist ein gerichteter Baum |
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mit einem einzelnen Knoten, der dem (meist rechnerisch ermittelten) |
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nächsten gemeinsamen Vorfahren aller Einheiten im Baum entspricht. |
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Ein ''ungewurzelter'' Baum dagegen besitzt keinen ausgezeichneten |
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nächsten gemeinsamen Vorfahren, sondern soll lediglich die |
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Verwandtschaftsnähe oder -ferne der einzelnen Arten |
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darstellen. Näheres zu gewurzelten und ungewurzelten Bäumen ist im |
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Artikel [[Wälder und Bäume in der Graphentheorie]] nachzulesen. |
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==Kritik== |
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* Per Definition können phylogenetische ''Bäume'' [[Hybridisierung (Molekularbiologie)|Hybridisierung]] und [[lateraler Gentransfer|lateralen Gentransfer]], die ebenfalls wichtige Methoden der Genübertragung sind, nicht darstellen. Deshalb vertreten einige Forscher die Ansicht, dass man nicht einen ''Baum'' sondern vielmehr ein phylogenetisches [[Netz]] aufbauen sollte (das sich im Sinne der [[Graphentheorie]] von einem Baum dadurch unterschiedet, dass es "Querverbindungen" zwischen sonst nicht direkt verwandten Arten zulässt). |
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* Bäume, die [[aussterben|ausgestorbene]] Arten nicht enthalten, müssen mit Vorsicht interpretiert werden (siehe auch obige Bemerkung zur Interpretation). |
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==Literatur== |
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[[Arndt von Haeseler]], [[Dorit Liebers]]: ''Molekulare Evolution'', |
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Fischer 2003, ISBN 3596153654 |
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==Siehe auch== |
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* [[Dendrogramm]] |
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* [[evolutionärer Stammbaum]]--> |
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|||
[[de:Phylogenetischer Baum]] |
|||
[[en:Phylogenetic tree]] |
|||
[[vi:Cây phát sinh chủng loại]] |
Kiel registrite je 20:38, 23 feb. 2005
Filogenetika arbo estas arboforma skemo, kiu bildigas kiel el unu specio evoluis pluraj.
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